Priekopnícky test s výsledkom v ten istý deň pomáha lekárom odhaliť skryté infekcie aj infekcie odolné voči liekom u kriticky chorých detí. Vzorky z dýchacích ciest viac ako stovky mladých pacientov londýnskej detskej nemocnice Great Ormond Street Hospital (GOSH) vo Veľkej Británii putovali na takzvané metagenomické testovanie. Táto metóda dokáže z jedinej vzorky určiť baktérie, vírusy aj huby. V mnohých prípadoch tak priamo ovplyvňuje, aké lieky lekári predpíšu. Ako informuje britská stanica BBC, metagenomika odhalí aj infekcie, ktoré štandardné testy prehliadnu, čo pre niektorých kriticky chorých pacientov znamená lepšie výsledky liečby.

Príbeh Willow: Test jej zachránil život

V marci ochorela desaťročná Willow Crowther z grófstva Kent na zápal pľúc. Choroba mala dramatický priebeh. Spustila u dievčatka epileptický záchvat a opakované zastavenie srdca. Willow previezli na jednotku intenzívnej starostlivosti v nemocnici GOSH.

Jej mama Stacey Moore sa od lekárov dozvedela, že dcéra má len 50-percentnú šancu na prežitie. "Lekár nám povedal, že by sme mali zavolať rodinu, aby sa s ňou rozlúčila. Tak kritický bol jej stav a tak veľmi hrozilo, že zomrie," spomína.

Nesprávne antibiotikum

Tím v GOSH siahol po metagenomike. Ide o diagnostický test, ktorý funguje tak, že osekvenuje všetok genetický materiál prítomný vo vzorke. Pri bežných metódach musia lekári vopred rozhodnúť, čo vlastne hľadajú. Táto metóda takéto rozhodnutie nevyžaduje.

Test ukázal, že Willow trpí bakteriálnou infekciou odolnou voči liekom. Potrebovala preto iné antibiotikum, než aké jej pôvodne predpísali.

Vďačnosť rodiny

"To, že mali k dispozícii takýto test, bolo pre ňu rozhodujúce. Zachránilo jej to život," povedala Stacey. "Je zázrak, že je tu s nami, a sme za to nesmierne vďační," doplnil Willowin otec Russ.

Vďaka správnej liečbe sa dievčatko z infekcie napokon zotavilo. V nemocnici však strávilo niekoľko mesiacov. Willow je jednou z mnohých pacientok a pacientov detskej nemocnice, ktorým nový typ testovania pomohol.

Čo ukázala štúdia na detskej intenzívke

V rokoch 2024 až 2025 lekári použili metagenomické testovanie u 122 kriticky chorých detí na pediatrickej jednotke intenzívnej starostlivosti v GOSH. Výsledky štúdie teraz uverejnil odborný časopis Lancet Microbe.

Tisíce patogénov z jednej vzorky

Metagenomické testovanie analyzuje všetok genetický materiál vo vzorke. Dokáže tak odhaliť tisíce rôznych patogénov. Najrozšírenejší spôsob určovania baktérií je pritom ich kultivácia na Petriho miskách, teda technológia, ktorú lekári používajú už od viktoriánskej éry.

Ďalšia metóda, PCR test, dokáže určiť vírusy a niektoré baktérie. Lekári však musia presne zadať, čo chcú nájsť.

Výsledky v číslach

Štúdia priniesla viacero dôležitých zistení:

• metagenomické testovanie v GOSH odhalilo približne deväť z desiatich baktérií a vírusov vo vzorkách,
• podarilo sa mu identifikovať všetky huby,
• v štvrtine prípadov výsledky ovplyvnili predpisovanie liekov, napríklad nasadenie, vysadenie alebo zmenu antibiotika,
• test zachytil 50 organizmov, ktoré bežná diagnostika neodhalila.

Posledné zistenie naznačuje, že metóda by mohla slúžiť aj ako včasné varovanie pred novými infekciami.

Boj s rezistenciou a ochrana pred pandémiami

Dr. Sam Ray, špecialista na pediatrickú intenzívnu medicínu v GOSH a spoluautor štúdie, vysvetlil, že tradičné testovanie núti lekárov kvalifikovane odhadnúť, akú infekciu hľadajú. "Štúdia nám pomohla zachytiť infekcie, ktoré by sme inak prehliadli, nasadiť deťom správnu liečbu a ukončiť podávanie antibiotík, keď vieme, že nezaberú," uviedol.

Podľa neho má odstránenie zbytočnej liečby veľký význam. "Je to mimoriadne dôležité v boji proti narastajúcej antimikrobiálnej rezistencii," zdôraznil.

Rozšírenie do ďalších nemocníc

Dr. Julianne Brown, vedúca metagenomického pracoviska v GOSH a jedna z hlavných autoriek štúdie, uviedla, že nové testovanie postupne zavádzajú približne na 30 jednotkách intenzívnej starostlivosti po celej Veľkej Británii. Tieto pracoviská liečia dospelých aj deti.

"Mohol by to byť silný nástroj na odhaľovanie nových infekcií, ktoré predstavujú hrozbu pandémie," dodala. "Ak by sa v budúcnosti objavil nový neznámy patogén, ktorý by mohol spôsobiť ďalšiu pandémiu, veľmi rýchlo by sme ho odhalili a prijali správne opatrenia."

Nadväznosť na skoršie skúšky

Projekt v GOSH nadväzuje na skúšky v nemocničnej sieti Guy’s and St Thomas‘ NHS Trust. Práve tam ako prví použili metagenomiku na testovanie respiračných infekcií u dospelých pacientov.